En las tres últimas décadas, una generación de simpatizantes tombinos se fue acostumbrando al protagonismo de Godoy Cruz en las principales competencias, tanto del fútbol de la AFA como de la Conmebol.

De ahí que creció la masividad de aficionados a partir de 1994 cuando se logró el tan ansiado ascenso a la categoría de la por entonces denominada Primera B Nacional tras haber empatado sin tantos con Guaraní Antonio Franco en Posadas, Misiones, y se conquistó el Torneo del Interior.

En la ida, el Tomba -dirigido por Alberto Garro- había formado con: Claudio Manchado; Villalobos, Iglesias, Oldrá y O. Almeida; R. Almeida, Franco, Marcucci (reemplazado por Lentz a los 77') y Pereyra (reemplazado por Cuello a los 88'); Naves y Abaurre.

Ese partido de ida se había disputado en el Estadio "Feliciano Gambarte", ante 18.000 espectadores. y lo ganó el "Expreso"
con un gol de Hipólito Naves a los 45' del primer tiempo.

Ese plantel disputó 22 partidos: ganó 12, empató 6 y perdió 4 con una cosecha de 30 puntos cuando aún se sumaba de a dos unidades por juego ganado.

El goleador del equipo fue Alejandro Abaurre con 10 tantos, seguido por Hipólito Naves con 9.

En 1994 acumuló 50 puntos, obtuvo el tercer mejor promedio para el descenso y logró el 4º puesto en las posiciones.

Así llegó a jugar su primer Torneo Reducido, enfrentando a Quilmes en cuartos de final: empató en ambos encuentros de ida y vuelta, y el Tomba pasó a semifinales por el gol obtenido fuera de casa.

En semifinales enfrentó a Colón, con el que empató 0-0 en Mendoza y cayó 5-0 en Santa Fe.

LA RESURRECCIÓN EN 1995

Fue un torneo clave para la actualidad de Godoy Cruz. Ese año descendieron 7 equipos y el Tomba había realizado una mala primera fase, lo que lo tuvo todo el año como uno de los equipos candidatos al descenso.

De la mano de Luis Manuel Blanco, el equipo realizó una segunda fase brillante y mantuvo la categoría empatando en San Juan ante San Martín 1 a 1, dejando afuera al Verdinegro del reducido y ocupando su lugar.

Además, el 9 de abril de 2002, Godoy Cruz venció a Independiente Rivadavia por 1 a 0 con gol del "Cachorro" Abaurre, y mandó a la Lepra al Argentino A.

UN POSITIVO 2002

Godoy Cruz se consagró campeón del Torneo Apertura de la Primera B Nacional, una fecha antes de la finalización del certamen de ascenso.

El Tomba le ganó a Ben Hur de visitante 1 a 0 con gol de Mauro Poy, y su escolta Almagro perdió ante Unión 3 a 1.

El Expreso se aseguró un lugar en la final por un ascenso a Primera, que a la postre ganaría ante Nueva Chicago.

El elenco mendocino jugó 19 encuentros, de los cuales ganó 12, empató 4 y perdió 3. Anotó 29 goles y recibió 14, con lo que cosechó 40 puntos.

Los goleadores del equipo fueron Daniel Giménez, Mauro Poy y Mariano Torresi, con 5 conquistas cada uno.

LA HISTÓRICA LLEGADA A PRIMERA EN 2005

Godoy Cruz logró el Apertura de la Primera B Nacional, con 40 puntos, producto de 12 victorias, 4 empates y 3 derrotas, con 29 goles a favor y 14 en contra.

El 3 de diciembre de 2005, Godoy Cruz se consagró campeón al derrotar a Ben Hur 1 a 0, con gol de Mauro Poy, cuando solo quedaban 5' para terminar el partido y el equipo jugaba con un hombre menos.

Ese año el equipo tuvo a tres goleadores con 5 tantos: Giménez, Torresi y Poy.

Ese triunfo le dio derecho a disputar dos finales contra Nueva Chicago, el campeón del Clausura.

El 16 de mayo de 2006, se disputó la primera final en Mataderos, con 7.000 hinchas tombinos apoyando al equipo. El juego terminó 1-1: Godoy Cruz se puso en ventaja con gol de Mariano Torresi y luego empató el local con tanto de Federico Higuaín.

El 20 de mayo de 2006 se jugó la revancha en el Malvinas Argentinas ante 40.000 personas.

Esa noche, Godoy Cruz venció a Chicago 3-1, con 2 goles de Daniel "Tanque" Giménez y uno de Diego Villar para el Bodeguero; el descuento fue de César Carranza para el Torito de Mataderos.

Así, el Tomba ganó el global 4-2 y logró su primer ascenso a Primera División.

EL INOLVIDABLE DEBUT EN PRIMERA

El debut en Primera División se produjo el 20 de mayo de 2006 en el Torneo Apertura 2006. En esa primera mitad de la temporada, Godoy Cruz sumó 17 puntos, destacándose una victoria histórica ante Independiente 3-1 en la Fecha 10, la primera en la era profesional.

En el Torneo Clausura 2007, el equipo obtuvo 25 puntos. En la serie de promoción, Godoy Cruz enfrentó a Huracán. En el partido de ida, disputado en Parque Patricios, el Tomba cayó 0-2. En la vuelta, en Mendoza, el equipo mendocino perdió 3-2, con goles de Osvaldo Miranda y Martín Arzuaga.

Huracán se impuso con un resultado global de 5-2, lo que significó el descenso de Godoy Cruz a la Primera B Nacional.

LA VUELTA A PRIMRA EN 2006

Tras perder la Promoción ante Huracán y regresar a la Primera B Nacional, Godoy Cruz mantuvo la expectativa de que se podía lograr nuevamente el ascenso, y así, con Sergio Batista primero y Daniel Oldrá después, volvió a ascender tras un año en la categoría. La llegada a Primera División se produjo de manera directa, ya quedó segundo detrás de San Martín de Tucumán.

CON EL "TURCO" EN 2008

Con  Omar Asad como DT, en el Torneo Clausura 2010 se hizo una excelente campaña: tercer puesto con 37 puntos, que lo posicionaron como el club indirectamente afiliado a la AFA con más puntos en un torneo corto, 44. De esta manera, Godoy Cruz se clasificó a la Copa Libertadores por primera vez en su historia y fue el primer equipo mendocino en lograrlo.

Ya con Jorge Da Silva como DT se repitió el 3° lugar alcanzado en el Clausura 2011 y además se consiguió la histórica clasificación a la Copa Sudamericana tras vencer a Racing en Avellaneda.

LA PRIMERA LIBERTADORES

En el debut de la Copa Libertadores 2011, por el Grupo 8, el Tomba derrotó a Liga Deportiva Universitaria de Quito por 2-1. En el segundo partido cayó de local frente a Peñarol por 3-1. En el tercer partido volvió a la victoria frente a Independiente en Avellaneda y por 3-1. Después volvió a enfrentar al Rojo de local y fue 1-1. En el quinto juego, el Expreso viaja a Uruguay para enfrentar a Peñarol, y cayó por 2-1. En la última fecha, en Ecuador, perdió 2-0 con la LDU..

LA SUDAMERICANA 2011

En la Copa Sudamericana 2011, en el partido de ida frente a Lanús, empató 2-2. En la vuelta empató 0-0 y pasó a 1/8 de final. En los octavos jugó con Universitario de Lima: 1-1 en Mendoza y en la vuelta en 1-1; lo que los llevaría a en los penales, donde perdió 3-2.

LA SEGUNDA LIBERTADORES

En el debut de la Copa Libertadores 2012, otra vez por el Grupo 8, derrotó 1-0 a Peñarol.

Después perdió por goleada con Universidad de Chile en Santa Laura y empató 4-4 con Atlético Nacional en Mendoza.

Luego llegó el empate en Medellín y una nueva derrota ante la U de Chile que dejó al Expreso eliminado de la competencia en la fase de grupos.

En 2014 Godoy Cruz jugó por segunda vez la Copa Sudamericana, en su cuarta participación a nivel internacional.

El Tomba quedó eliminado en segunda fase, donde fue superado por River Plate en los dos encuentros, de ida y de vuelta. El Millo ganó por 1-0 en Mendoza y 2-0 en el Monumental.

Godoy Cruz realizó un gran primer semestre aprovechando un torneo corto que se jugó por zonas. El Expreso llegó a la fecha final con claras chances de ganar su grupo y medirse con Lanús para definir el campeón.

En la última jornada el Tomba perdió 2-0 con San Martín de San Juan y, gracias al empate de San Lorenzo ante Banfield, fue el Ciclón el que disputó el partido definitorio con el Granate.

Godoy Cruz terminó en cuarto lugar, lo que le dio la chance de jugar en 2017 su tercera Copa Libertadores

Tercera Libertadores e histórica clasificación a octavos de final de la Copa Libertadores. Godoy Cruz consiguió el punto que necesitaba y concretó una histórica clasificación para los octavos de final de la Copa Libertadores de América.

El Tomba recibió a Libertad y avanzó de ronda con el 1-1 ante los paraguayos. La visita se puso en ventaja a los 23 minutos del primer tiempo con un cabezazo de Danilo Santacruz, mientras que el equipo argentino lo empató a los 39 del mismo período por Juan Garro.

Los conducidos por Lucas Bernardi terminaron el partido con diez futbolistas por la expulsión de Ángel González, quien recibió una roja directa.

EL SUBCAMPEÓN 2017/2018

Godoy Cruz le ganó 2-0 a Tigre en Mendoza y coronó el mejor campeonato de su historia al terminar como subcampeón de la Superliga Argentina, a sólo dos puntos de Boca. El "Morro" García, con 17 goles, fue el goleador del torneo.

El Bodeguero cerró el torneo de Primera División con un 56 puntos y quedó a solo dos unidades de Boca Juniors, campeón con 58 puntos.

Dabove, el entrenador que reemplazó a Mauricio Larriera al frente del plantel, cosechó 39 puntos y el Tomba cerró su mejor campaña en Primera División y se adueñó de un histórico subcampeonato.

Godoy Cruz ganó los últimos dos partidos del grupo y avanzó a octavos de final de la Copa Libertadores 2019.

Con Lucas Bernardi como DT el Tomba empató sin goles ante Olimpia 0-0, luego 1-1 ante Sporting Cristal en Perú con gol de Cardona y sin goles en Chile ante la Universidad de Concepción.

En la segunda ronda fue derrota 2-1 en Asunción 2-1 con Olimpia con llegó la recuperación de local y con ello la segunda clasificación a octavos en la historia de la institución: triunfo 2-0 ante Sporting Cristal con tantos de Viera de penal y Lucero y victoria por la mínima ante la U de Concepción con el tanto de Ángel González. Luego perdió la serie siguiente ante Palmeiras.

En la Copa Argentina 2021, Godoy Cruz llegó a las semifinales del certamen, con Diego Flores.

El camino: en 32avos de final 3-1 a a Justo José de Urquiza 3-1. En 16avos de final venció a Racing Club en una emocionante definición por penales, tras empatar 3-3 en el tiempo reglamentario. En Octavos de final superó a Tigre 1-0, con un gol agónico de Martín Ojeda de tiro libre a los 88 minutos, en el Estadio Mario Alberto Kempes de Córdoba.

En la semifinal, disputada en el Estadio "Juan Gilberto Funes" de San Luis, Godoy Cruz cayó 1-0 ante Talleres de Córdoba. El único gol del partido fue convertido por Diego Valoyes de penal.

LA COPA DE LA LIGA PROFESIONAL 2023

En la Copa de la Liga Profesional 2023, Godoy Cruz, bajo la dirección del "Gato" Oldrá, tuvo una campaña destacada con un plantel de categoría  y que incluyó a Hernán López Muñoz, Tadeo Allende, Tomás Conechny y Diego ‘Ruso' Rodríguez.

En Fase de grupos, el Tomba finalizó segundo en la Zona B con 22 puntos. En Cuartos de final venció a Banfield por penales, avanzando a semifinales, en un partido disputado en La Pedrera, San Luis. Luego, en semifinales, empató 1-1 con Platense en tiempo reglamentario. En la tanda de penales, cayó 6-5.

LA DESTACADA CAMPAÑA EN 2023

Gracias a su desempeño en la temporada 2023, Godoy Cruz obtuvo un cupo para la Copa Libertadores 2024, en la quinta participación en el torneo continental.

El Tomba jugó la segunda fase preliminar frente al Colo-Colo de Chile. La derrota 1-0 en Mendoza y la igualdad 0-0 en Santiago dejaron eliminado al Expreso de Oldrá rápidamente de la competencia internacional.

En 2025 tuvo una destacada performance en la Copa Sudamericana, en la que cerró su participación perdiendo el global ante Atlético Mineiro, con sendas caídas en Belo Horizonte (2-1) y en el "Gambarte" (1-0).

EL REGRESO A CASA