La construcción de la obra El Baqueano lleva varios capítulos y mucha polémica debido a la denuncia que realizó el Gobernador de La Pampa, Sergio Ziliotto. Pese a las trabas que le pone La Pampa, Vaquié admitió que se procederán con la licitación y luego los estudios ambientales e hidrológicos. 

En diálogo con Radio Nihuil, el Ministro subrayó "Vamos a avanzar con la licitación, tenemos que cumplir con los pasos formales, cumplir con la declaración de impacto ambiental". Además agregó: "hacer los estudios geológicos e hidrológicos, que los estamos haciendo. Se licita y el proceso se continúa y se ve como se sigue". 

https://jornadaonline.com/politica/el-baqueano-el-gobernador-de-la-pampa-vuelve-a-poner-palos-en-la-rueda-contra-mendoza-2023599160

Enrique Vaquié comparó la demanda de Ziliotto con una realizada por una obra parecida en la Provincia de San Juan durante el año 2018, ante esto Vaquié confesó: "Uno puede buscar el paralelismo con San Juan. En el 2018, cuando el gobernador (Sergio) Uñac anunció la obra de El Tambolar, Ziliotto hizo un amparo ante la Corte Suprema y eso no ha tenido ningún curso hasta el presente". 

Luego agregó: "La Pampa hizo un escandalete igual a este y la obra se licitó en 2018 y en el 2019 se firmó contrato con la UTE que hoy está construyendo la obra de El Tambolar y se sigue construyendo y la Corte todavía no ha dicho nada sobre la presentación de La Pampa". 

https://jornadaonline.com/politica/el-baqueano-vaquie-y-ziliotto-protagonizaron-un-picante-ida-y-vuelta-20235711390

Finalizando, el Ministro comentó de manera irónica que "En cualquier momento nos van a pedir que cuando se riegue un jardín haya que pedirle permiso al gobernador pampeano". 

https://jornadaonline.com/economia/suarez-logro-un-historico-convenio-con-nacion-para-el-desarrollo-del-el-baqueano--202342717280